W związku ze stałym rozwojem Spółki, od lutego 2017 roku NAFTOR Sp. z o.o. świadczy usługi ochrony dla kolejnej spółki Grupy Kapitałowej PERN S.A. z sektora energetycznego – NAFTOPORT Sp. z o.o., której działalność stanowi ważny element w dostawie ropy dla polskich i niemieckich rafinerii (a także jej tranzyt i lądowo – morski przeładunek produktów naftowych). Na podstawie umowy z Przedsiębiorstwem Przeładunku Paliw Płynnych NAFTOPORT Sp. z o.o., NAFTOR ochrania siedzibę Spółki NAFTOPORT w Gdańsku.